开开财税导读：吉林省税务局聚焦种业企业特点，依托“一户一档一团队”机制，全链条编制《种业税费政策指引》，推出研发费用加计扣除政策辅导、种子种苗免税“清单式”落实等服务举措，推动税费红利持续反哺新品种选育和良种扩繁。

一、种业企业：建立研发辅助账、规范归集核算

吉林省鸿翔农业集团鸿翔种业有限公司育种投入大、周期长，此前研发费用怎么归集、能不能应享尽享心里没底。税务干部指导企业建立研发辅助账、规范归集核算，确保符合加计扣除政策要求，2025年公司享受研发费用加计扣除额2169万元，企业拥有自主知识产权且投入市场的品种达126个，其中杂交玉米商品种子销售总额位居全国第四。

二、人参等多业态：分板块各归各账

抚松县是国家区域性中草药良种繁育基地。吉林省山中仙土特产有限公司一边开展种质繁育、一边布局直播销售，多业态并行导致账务核算犯难。当地税务部门深入辖区12家人参企业调研座谈，征集实操难题与政策疑问，帮助经营主体建立常态化内部财税管控制度，从源头化解行业涉税风险。

三、涉农合作社：明白卡加收购发票自行开具

通化市二道江区龙力食用菌种植农民专业合作社引进3个高产抗逆品种，种植面积从20亩扩至近60亩。税务部门上门辅导，梳理《涉农税费政策明白卡》，推广农产品收购发票自行开具，让农户足不出村即可完成开票业务。永吉县万昌镇禾谷丰水稻种植农民专业合作社搭建智慧农业云平台并开展电商销售、拓展海外市场，税务部门针对性辅导其规范电商销售涉税处理和纳税申报，并对出口退税政策适用与申报流程进行专门辅导。

四、全链条风险管理

吉林省税务局已制定农产品全链条风险指标44个、建立风险筛查模型11个，构建农产品收购“源头可溯、风险可控、责任可追”的管理体系，实现风险精准识别、自动提醒、闭环管理。在税费优惠支持下，吉林省已建成公主岭水稻、洮南玉米、抚松人参3个国家认定的制种基地，主要农作物良种覆盖率保持100%。

五、对涉农企业的提示

粮食产业链越长，涉税环节越多。种业、农产品加工企业应规范建立研发辅助账、按板块分账核算，准确适用农产品初加工等税收优惠和进项税额核定扣除政策；收购环节要规范凭证管理与台账，做到业务流、货物流、资金流、发票流一致，把“种、产、销”全链条涉税事项理清。

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来源：国家税务总局（吉林省税务局）｜发布日期：2026-09-24

官方原文：https://www.chinatax.gov.cn/chinatax/n810219/n810739/c5252619/content.html

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